Rétrovirus

Définition des rétrovirus

Les virus sont classés en fonction de leur forme, de leur génome et de leur mode de réplication.² Les virus varient en fonction du matériel génétique qu'ils contiennent. Le génome d'un virus peut être simple ou double brin et peut être composé d'ARN ou d'ADN.

Les rétrovirus sont constitués de deux segments d'ARN simple brin, d'une capside et d'une enveloppe.² Les rétrovirus ont été nommés ainsi parce qu'ils contiennent de la transcriptase inverse.³ Ils transcrivent leur génome d'ARN en ADN, à l'opposé de l'ordre habituel de l'expression des gènes. En général, l'ADN est transcrit en ARN, puis traduit en protéines. Chez les rétrovirus, l'ordre de la première étape est inversé.

Exemples de rétrovirus

Il existe de nombreux types de rétrovirus. Lesrétrovirus sont classés en trois familles: Lesoncovirus, les lentivirus et les spumavirus (tu n'as pas besoin de connaître ces noms).⁴ Les rétrovirus sont également classés en fonction de leur morphologie.⁴ Le rétrovirus le plus célèbre, ou tristement célèbre, est le virus de l'immunodéficience humaine (VIH), qui provoque le syndrome d'immunodéficience acquise (SIDA). Un autre rétrovirus bien connu est le virus de la leucémie des cellules T humaines (HTLV), qui peut provoquer la leucémie.⁴

Figure 3. Structure du VIH, source Wikimedia Commons

Le VIH infecte lesglobules blancs de l'organisme , les cellules primaires du système immunitaire. Le VIH infecte ces cellules, en particulier les lymphocytes T CD4, et les tue à la fin de son cycle de réplication lorsque les virions sont libérés. Par conséquent, l'infection par le VIH rend l'organisme plus vulnérable à d'autres infections et maladies. En fait, ce n'est pas le VIH qui tue les gens, mais ces infectionsopportunistes. opportunistesqui profitent del'affaiblissement du système immunitaire (Fig. 3).

L'infection par le VIH se déroule en trois étapes. L'infection commence par une infection aiguë qui dure de quelques jours à quelques semaines.⁴ Elle évolue vers une infection chronique qui peut durer des décennies avant d'évoluer vers le sida, la forme la plus grave de l'infection par le VIH.⁴ Le sida a une durée de survie de quelques années sans traitement.⁴ Le traitement peut empêcher la progression vers le sida^.4 L'infection par le VIH est incurable, mais le traitement est très efficace.

Le HTLV a été le premier rétrovirus découvert,⁵ bien qu'il soit beaucoup moins courant que le VIH. Le HTLVa également été le premier rétrovirus oncogène, ou cancérigène, découvert.⁶ Comme le VIH, le HTLV se transmet par contact avec des fluides corporels infectés.⁶ L'infection par le HTLV est généralement asymptomatique ou n'entraîne aucun symptôme ou maladie.⁶ Dans de rares cas, l'infection par le HTLV peut entraîner un cancer (leucémie ou lymphome), des troubles cutanés, des troubles du système nerveux ou d'autres affections médicales.⁶

Un autre rétrovirus qui s'est répandu au fil des ans est le SARS-COV-2. Ce virus est à l'origine de la maladie COVID-19 et peut être très mortel pour certaines sous-populations. Le virus du SRAS-COV-2 pénètre dans les cellules de l'hôte par le récepteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2). Une fois à l'intérieur de la cellule, le virus se lie à des récepteurs spécialisés appelés récepteurs Toll-Like. Ces récepteurs ont pour fonction d'alerter le système immunitaire de l'hôte de la présence d'un virus étranger.

La première ligne de défense du corps est le système immunitaire inné. Lorsqu'un virus s'empare d'une cellule, des facteurs de transcription tels que Nf-kb se transposent dans le noyau et modifient l'expression génétique de la cellule hôte pour lui faire produire les cytokines nécessaires à la lutte contre l'infection virale. Les cytokines telles que l'IL6 et le TNF-a sont des cytokines pro-inflammatoires qui agissent comme médiateurs de la réponse antivirale de l'organisme. Les rétrovirus comme le SRAS ont développé des moyens d'échapper aux protocoles et à la détection du système immunitaire, ce qui peut conduire à une infection généralisée de l'hôte.

Rétrovirus endogène

Les rétrovirus endogènes humains sont des éléments génétiques hérités qui se sont intégrés à notre génome à la suite d'infections survenues au cours de l'évolution humaine. Lesrétrovirus peuvent être classés en exogènes et endogènes en fonction de leur transmission . Les rétrovirusendogènes sont des provirus, tandis que les rétrovirus exogènes, comme le VIH, sont ceux auxquels nous pensons habituellement lorsque nous évoquons les rétrovirus.⁴ Les rétrovirus exogènes sont infectieux, tandis que les virus endogènes ne sont pas infectieux et sont souvent des virus incomplets ou autrement défectueux.⁴

Cycle de vie des rétrovirus/réplication des rétrovirus

Le cycle de vie des rétrovirus est divisé en deux phases, précoce et tardive.¹⁰ La phase précoce comprend les étapes initiales de la liaison du rétrovirus à la cellule hôte jusqu'à l'intégration de l'ADNc viral dans le génome de la cellule.¹⁰ Laphase tardive comprend les étapes de l'expression des gènes viraux jusqu'à la libération des virions^.10 Les virus utilisent les molécules, les protéines et la machinerie de la cellule hôte pour se répliquer.

Figure 5. Cycle de vie d'un rétrovirus, y compris la réplication ; source : Wikimedia Commons

La première étape du cycle de vie du rétrovirus est la liaison.¹⁰ Au cours de cette étape, le rétrovirus se lie à la cellule cible (Fig. 5, étape 2).¹⁰ Après la liaison, les protéines de l'enveloppe virale interagissent avec des protéines réceptrices spécifiques à la surface de la cellule hôte pour que le rétrovirus puisse entrer dans la cellule cible (Fig. 5, étape 3).¹⁰ Laplupart des rétrovirus entrent par fusion avec la cellule cible ; l'enveloppe fusionne avec la membrane plasmique de la cellule cible et le noyau viral, composé d'ARN et de protéines protégés par une capside, pénètre dans le cytoplasme de la cellule cible. La capside du noyau se dégrade, libérant l'ARN et les protéines.

Dans le cytoplasme, la transcriptase inverse convertit le génome ARN en brins d'ADN complémentaire (ADNc) (Fig. 5, étape 4).¹⁰ L'ADNc est répliqué pour créer des séquences d'ADN double brin (Fig. 5, étape 5).¹⁰ Cet ADN se déplace ensuite vers le noyau et s'insère dans le génome de la cellule hôte (Fig. 5, étape 6).¹⁰ Une fois intégré au génome, l'ADN viral peut être transcrit en ARN pour servir de génome aux virions et en ARNmessager (ARNm) pour être traduit en protéines virales (Fig. 5, étapes 7-8). Les virions sont assemblés dans le cytoplasme de la cellule hôte et libérés par bourgeonnement à travers la membrane plasmique de la cellule, acquérant ainsi une enveloppe (Fig. 5, étape 9).¹¹